পাবমেড

From LTRC

ru vanc

Biodatabase
title পাবমেড
center United States National Library of Medicine (NLM)
released 1
url pubmed.ncbi.nlm.nih.gov
screenshot

পাবমেড (PubMed) হলো একটি উন্মুক্ত ও বিনামূল্যে ব্যবহারযোগ্য ডেটাবেস, যা মূলত জীবন বিজ্ঞান (life sciences) এবং বায়োমেডিক্যাল (biomedical) বিষয়ের ওপর ভিত্তি করে MEDLINE গ্রন্থপঞ্জি ডেটাবেস এবং সারসংক্ষেপ প্রদান করে। ন্যাশনাল ইনস্টিটিউটস অফ হেলথ-এর অন্তর্গত United States National Library of Medicine (NLM) তাদের Entrez তথ্য পুনরুদ্ধার (information retrieval) ব্যবস্থার অংশ হিসেবে এই ডেটাবেসটি পরিচালনা করে।[1]

১৯৭১ থেকে ১৯৯৭ সাল পর্যন্ত, MEDLINE ডেটাবেসে অনলাইন অ্যাক্সেস মূলত কম্পিউটার এবং টেলিফোন লাইনের মাধ্যমে বিভিন্ন প্রাতিষ্ঠানিক সুবিধা, যেমন—বিশ্ববিদ্যালয় গ্রন্থাগার থেকে পাওয়া যেত।[2] ১৯৯৬ সালের জানুয়ারিতে প্রথম মুক্তি পাওয়া পাবমেড, ব্যক্তিগতভাবে বিনামূল্যে ঘরে বা অফিসে বসে MEDLINE অনুসন্ধানের যুগের সূচনা করে।[3] এটি "ইন্টারনেট গ্রেটফুল মেড" (Internet Grateful Med)-এর সাথে মুক্তি পেয়েছিল, যা ছিল Grateful Med-এর একটি ওয়েব সংস্করণ। ২০০১ সালে গ্রেটফুল মেড বন্ধ করে দেওয়া হয় এবং সম্পূর্ণভাবে পাবমেড দ্বারা প্রতিস্থাপিত হয়। ১৯৯৭ সালের জুন মাস থেকে পাবমেড ব্যবস্থাটি জনসাধারণের জন্য বিনামূল্যে উন্মুক্ত করা হয়।[2] 3

বিষয়বস্তু

MEDLINE ছাড়াও পাবমেড নিম্নলিখিত বিষয়গুলোতে অ্যাক্সেস প্রদান করে:

  • Index Medicus-এর মুদ্রিত সংস্করণের ১৯৫১ সাল বা তার আগের পুরনো তথ্যসূত্র।
  • কিছু জার্নালের তথ্যসূত্র, যা Index Medicus বা MEDLINE-এ অন্তর্ভুক্ত হওয়ার আগের; যেমন—Science, BMJ, এবং Annals of Surgery।
  • কোনো নিবন্ধ Medical Subject Headings (MeSH) দ্বারা সূচিবদ্ধ হওয়ার আগে এবং MEDLINE-এ যুক্ত হওয়ার আগের অতি সাম্প্রতিক এন্ট্রি।
  • সম্পূর্ণ পাঠ্য (full-text) হিসেবে উপলব্ধ বইয়ের সংগ্রহ এবং NLM রেকর্ডের অন্যান্য উপসেট।[4]
  • PMC সাইটেশন।
  • NCBI বুকশেলফ।

পাবমেডের অনেক রেকর্ডে সম্পূর্ণ নিবন্ধের লিঙ্ক থাকে, যার কিছু বিনামূল্যে পাওয়া যায়, যা প্রায়শই PubMed Central[5] এবং স্থানীয় মিরর সাইট যেমন—Europe PubMed Central-এ থাকে।[6]

MEDLINE-এ সূচিবদ্ধ এবং পাবমেডের মাধ্যমে উপলব্ধ জার্নালগুলোর তথ্য NLM ক্যাটালগে পাওয়া যায়।[7]

২০২৫ সালের ১৫ মার্চ পর্যন্ত, পাবমেডে ৪ কোটিরও বেশি সাইটেশন এবং সারসংক্ষেপ রয়েছে, যার তথ্য ১৯৬৬ সাল থেকে শুরু করে ১৮৬৫ সাল পর্যন্ত এবং অত্যন্ত বাছাইকৃতভাবে ১৮০৯ সাল পর্যন্ত পাওয়া যায়। ২০২৩ সালের হিসাব অনুযায়ী, পাবমেডের ২৪.৬ মিলিয়ন রেকর্ডের সাথে সারসংক্ষেপ এবং ২৬.৮ মিলিয়ন রেকর্ডের সাথে সম্পূর্ণ পাঠ্যের লিঙ্ক রয়েছে (যার মধ্যে ১০.৯ মিলিয়ন নিবন্ধ বিনামূল্যে সম্পূর্ণ পাঠ্য হিসেবে পাওয়া যায়)।[8] গত ১০ বছরে (৩১ ডিসেম্বর ২০১৯ পর্যন্ত), প্রতি বছর গড়ে প্রায় ১০ লক্ষ নতুন রেকর্ড যুক্ত হয়েছে।[9][10]

২০১৬ সালে, NLM তাদের সূচীকরণ ব্যবস্থায় পরিবর্তন আনে, যার ফলে প্রকাশকরা সরাসরি পাবমেডে সূচিবদ্ধ নিবন্ধের টাইপো এবং ভুল সংশোধন করতে পারেন।[11]

পাবমেডে কিছু শিকারি জার্নাল (predatory journals)-এ প্রকাশিত নিবন্ধ অন্তর্ভুক্ত হওয়ার খবর পাওয়া গেছে। ডেটাবেসে জার্নাল অন্তর্ভুক্তির ক্ষেত্রে MEDLINE এবং পাবমেডের নীতি কিছুটা ভিন্ন। পাবমেড সেন্ট্রালে জার্নাল সূচিবদ্ধ করার মানদণ্ড এবং পদ্ধতির দুর্বলতার কারণে শিকারি জার্নালের প্রকাশনাগুলো পাবমেডে ঢুকে পড়তে পারে।[12]

২০২৫ সালের ৪ মার্চ, পাবমেড ডেটাবেসে সাময়িকভাবে বিশ্বব্যাপী বিভ্রাট দেখা দেয়। এই বিভ্রাট প্রায় একদিন স্থায়ী ছিল এবং এটি 'ডেটাবেসের ভবিষ্যৎ নিয়ে উদ্বেগ' তৈরি করেছিল, কারণ বিশ্বজুড়ে গবেষকরা পিয়ার-রিভিউড বৈজ্ঞানিক সাহিত্যের জন্য পাবমেডের ওপর নির্ভরশীল। বিভ্রাটটি ইচ্ছাকৃত ছিল না এবং পরিষেবাগুলো পুনরুদ্ধার করা হয়েছে, তবে এই ঘটনাটি অপরিহার্য গবেষণা অবকাঠামোর নির্ভরযোগ্যতা এবং জরুরি পরিকল্পনা নিয়ে উদ্বেগের বিষয়টিকে সামনে নিয়ে এসেছে।[13]

বৈশিষ্ট্য

ওয়েবসাইট ডিজাইন

২০০৯ সালের অক্টোবরে পাবমেডের একটি নতুন ইন্টারফেস চালু করা হয়, যা গুগলের মতো দ্রুত অনুসন্ধান পদ্ধতি ব্যবহারের উৎসাহ দেয়; এগুলোকে 'টেলিগ্রাম' অনুসন্ধান হিসেবেও বর্ণনা করা হয়েছে।[14] ডিফল্টভাবে ফলাফলগুলো 'সবচেয়ে সাম্প্রতিক' (Most Recent) হিসেবে সাজানো থাকে, তবে এটি 'সেরা মিল' (Best Match), 'প্রকাশের তারিখ' (Publication Date), 'প্রথম লেখক' (First Author), 'শেষ লেখক' (Last Author), 'জার্নাল' বা 'শিরোনাম' অনুযায়ী পরিবর্তন করা যায়।[15]

২০২০ সালের জানুয়ারিতে পাবমেড ওয়েবসাইটের ডিজাইন এবং ডোমেইন আপডেট করা হয় এবং ১৫ মে ২০২০ থেকে নতুন বৈশিষ্ট্যসহ এটি ডিফল্ট হিসেবে কার্যকর হয়।[16] সাইটটি নিয়মিত ব্যবহারকারী অনেক গবেষকের কাছ থেকে এর বিরুদ্ধে সমালোচনামূলক প্রতিক্রিয়া এসেছিল।[17]

হ্যান্ডহেল্ড/মোবাইলের জন্য পাবমেড

August 2025 পাবমেড/MEDLINE হ্যান্ডহেল্ড ডিভাইসের মাধ্যমে অ্যাক্সেস করা যায়, উদাহরণস্বরূপ NLM কর্তৃক তৈরি "PICO" অপশন (সুনির্দিষ্ট ক্লিনিকাল প্রশ্নের জন্য) ব্যবহার করে।[18] একটি "পাবমেড মোবাইল" অপশনও উপলব্ধ, যা মোবাইল-বান্ধব এবং সরলীকৃত পাবমেড সংস্করণে অ্যাক্সেস প্রদান করে।[19]

অনুসন্ধান

সাধারণ অনুসন্ধান

পাবমেডের অনুসন্ধান উইন্ডোতে কোনো বিষয়ের মূল দিকগুলো লিখে সাধারণ অনুসন্ধান করা যেতে পারে।

পাবমেড এই প্রাথমিক অনুসন্ধানটিকে অনুবাদ করে এবং স্বয়ংক্রিয়ভাবে ফিল্ডের নাম, প্রাসঙ্গিক MeSH (Medical Subject Headings) টার্ম, সমার্থক শব্দ, বুলিয়ান অপারেটর (Boolean operators) যোগ করে এবং ফলাফলগুলোকে যথাযথভাবে 'নেস্ট' (nest) করে, যা অনুসন্ধান প্রক্রিয়াটিকে উল্লেখযোগ্যভাবে উন্নত করে। বিশেষ করে, এটি নিয়মিতভাবে টেক্সটওয়ার্ড এবং MeSH টার্মগুলোকে (OR অপারেটর ব্যবহার করে) একত্রিত করে।

বিস্তৃত অনুসন্ধান

পাবমেডে সর্বোত্তম অনুসন্ধানের জন্য এর মূল উপাদান MEDLINE এবং বিশেষ করে MEDLINE নিবন্ধ সূচিবদ্ধ করার জন্য ব্যবহৃত MeSH (Medical Subject Headings) নিয়ন্ত্রিত শব্দভাণ্ডার সম্পর্কে বোঝা প্রয়োজন। এর জন্য জটিল অনুসন্ধান কৌশল, ফিল্ডের নাম (ট্যাগ) ব্যবহার, সীমা নির্ধারণ এবং অন্যান্য ফিচারের সঠিক ব্যবহার প্রয়োজন হতে পারে; রেফারেন্স লাইব্রেরিয়ান এবং অনুসন্ধান বিশেষজ্ঞরা এই অনুসন্ধান পরিষেবা প্রদান করেন।[20][21]

পাবমেডের অনুসন্ধান উইন্ডোতে সরাসরি অনুসন্ধান শুধুমাত্র অস্পষ্ট বিষয় বা নতুন হস্তক্ষেপের ক্ষেত্রে সুপারিশ করা হয়, যার জন্য এখনও কোনো MeSH হেডিং তৈরি হয়নি, পাশাপাশি ওষুধের বাণিজ্যিক ব্র্যান্ড এবং সঠিক বিশেষ্য (proper nouns) অনুসন্ধানের জন্য। এটি তখনো কার্যকর যখন কোনো উপযুক্ত হেডিং থাকে না বা বর্ণনাকারী (descriptor) আংশিক দিক উপস্থাপন করে। MeSH থিসরাস ব্যবহার করে অনুসন্ধান করা আরও সঠিক এবং এতে অপ্রাসঙ্গিক ফলাফল কম আসে। উপরন্তু, এটি ফ্রি টেক্সট অনুসন্ধানের অসুবিধা থেকে রক্ষা করে, যেখানে বানান, একবচন/বহুবচন বা সংক্ষিপ্ত রূপের পার্থক্য বিবেচনায় নিতে হয়। অন্যদিকে, ডেটাবেসে সম্প্রতি যুক্ত নিবন্ধগুলোতে বর্ণনাকারী নির্ধারণ করা হয়নি, তাই সেগুলো খুঁজে পাওয়া যাবে না। অতএব, একটি সম্পূর্ণ অনুসন্ধান নিশ্চিত করার জন্য, নিয়ন্ত্রিত ভাষার হেডিং এবং ফ্রি টেক্সট টার্মের সংমিশ্রণ ব্যবহার করা আবশ্যক।[22]

জার্নাল নিবন্ধের প্যারামিটার

যখন একটি জার্নাল নিবন্ধ সূচিবদ্ধ করা হয়, তখন অসংখ্য নিবন্ধের প্যারামিটার বের করে কাঠামোগত তথ্য হিসেবে সংরক্ষণ করা হয়। এই ধরনের প্যারামিটারগুলো হলো: নিবন্ধের ধরন (MeSH টার্ম, যেমন—"ক্লিনিকাল ট্রায়াল"), মাধ্যমিক শনাক্তকারী (Secondary identifiers), ভাষা, জার্নালের দেশ বা প্রকাশের ইতিহাস (ই-প্রকাশের তারিখ, প্রিন্ট জার্নাল প্রকাশের তারিখ)।

প্রকাশনার ধরন: ক্লিনিকাল কোয়েরি/সিস্টেমেটিক রিভিউ

August 2025 প্রকাশনার ধরন প্যারামিটারটি বিভিন্ন ধরনের ক্লিনিকাল গবেষণার প্রতিবেদনসহ নিবন্ধের ধরন অনুযায়ী অনুসন্ধান করার সুযোগ দেয়।[23]

মাধ্যমিক আইডি (Secondary ID)

২০০৫ সালের জুলাই থেকে, MEDLINE নিবন্ধ সূচীকরণ প্রক্রিয়া নিবন্ধের সারসংক্ষেপ থেকে শনাক্তকারী বের করে এবং সেগুলোকে মাধ্যমিক শনাক্তকারী (Secondary Identifier - SI) নামক একটি ফিল্ডে রাখে। মাধ্যমিক শনাক্তকারী ফিল্ডটি আণবিক সিকোয়েন্স ডেটা, জিন এক্সপ্রেশন বা রাসায়নিক যৌগ এবং ক্লিনিকাল ট্রায়াল আইডিগুলোর বিভিন্ন ডেটাবেসের অ্যাক্সেস নম্বর সংরক্ষণ করার জন্য ব্যবহৃত হয়। ক্লিনিকাল ট্রায়ালের জন্য, পাবমেড দুটি বৃহত্তম ট্রায়াল রেজিস্ট্রি থেকে ট্রায়াল আইডি বের করে: ClinicalTrials.gov (NCT শনাক্তকারী) এবং ইন্টারন্যাশনাল স্ট্যান্ডার্ড র‍্যান্ডমাইজড কন্ট্রোলড ট্রায়াল নম্বর রেজিস্টার (IRCTN শনাক্তকারী)।[24]

আরও দেখুন

একটি রেফারেন্স যা বিশেষভাবে প্রাসঙ্গিক বলে মনে হয় তা চিহ্নিত করা যেতে পারে এবং "সম্পর্কিত নিবন্ধ" (related articles) শনাক্ত করা যেতে পারে। প্রাসঙ্গিক হলে, বেশ কয়েকটি গবেষণা নির্বাচন করা যেতে পারে এবং 'সম্পর্কিত ডেটা খুঁজুন' (Find related data) অপশন ব্যবহার করে (পাবমেড বা অন্য যেকোনো NCBI Entrez ডেটাবেসে) সেগুলোর সাথে সম্পর্কিত নিবন্ধ তৈরি করা যেতে পারে। সম্পর্কিত নিবন্ধগুলো তখন "সম্পর্কিততার" (relatedness) ক্রম অনুসারে তালিকাভুক্ত হয়। এই সম্পর্কিত নিবন্ধগুলোর তালিকা তৈরি করতে, পাবমেড একটি শক্তিশালী শব্দ-ভারযুক্ত অ্যালগরিদম ব্যবহার করে প্রতিটি সাইটেশনের শিরোনাম এবং সারসংক্ষেপের শব্দগুলোর পাশাপাশি নির্ধারিত MeSH হেডিংগুলোর তুলনা করে।[25] 'সম্পর্কিত নিবন্ধ' ফাংশনটিকে এতটাই নির্ভুল বলে মনে করা হয় যে একটি গবেষণাপত্রের লেখকরা পরামর্শ দিয়েছেন যে এটি একটি সম্পূর্ণ অনুসন্ধানের পরিবর্তে ব্যবহার করা যেতে পারে।[26]

MeSH-এ ম্যাপিং

পাবমেড স্বয়ংক্রিয়ভাবে MeSH টার্ম এবং সাবহেডিংগুলোর সাথে লিঙ্ক করে। উদাহরণস্বরূপ: "bad breath" লিঙ্ক করে (এবং অনুসন্ধানে অন্তর্ভুক্ত করে) "halitosis"-এর সাথে এবং "heart attack" লিঙ্ক করে "myocardial infarction"-এর সাথে। যেখানে উপযুক্ত, এই MeSH টার্মগুলো স্বয়ংক্রিয়ভাবে "প্রসারিত" (expanded) হয়, অর্থাৎ আরও সুনির্দিষ্ট টার্ম অন্তর্ভুক্ত করে। "nursing"-এর মতো টার্মগুলো স্বয়ংক্রিয়ভাবে "Nursing [MeSH]" বা "Nursing [Subheading]"-এর সাথে লিঙ্ক হয়। এই বৈশিষ্ট্যটিকে অটো টার্ম ম্যাপিং (Auto Term Mapping) বলা হয় এবং এটি ডিফল্টভাবে ফ্রি টেক্সট অনুসন্ধানে কার্যকর হয়, তবে সঠিক ফ্রেজ অনুসন্ধানে (অর্থাৎ ডাবল কোটেশনের মধ্যে অনুসন্ধান কোয়েরি রাখা) নয়।[27] এই বৈশিষ্ট্যটি পাবমেড অনুসন্ধানকে আরও সংবেদনশীল করে তোলে এবং চিকিৎসা পরিভাষার বৈচিত্র্যের জন্য ক্ষতিপূরণ দিয়ে ফলস-নেগেটিভ (মিস হওয়া) হিট এড়ায়।[27]

পাবমেড নিম্নলিখিত পরিস্থিতিতে টার্মের স্বয়ংক্রিয় ম্যাপিং প্রয়োগ করে না: উদ্ধৃত ফ্রেজ লিখে (যেমন—"kidney allograft"), অ্যাস্টেরিস্কে ট্রাঙ্কেট করলে (যেমন—kidney allograft*), এবং ফিল্ড লেবেল দিয়ে অনুসন্ধান করার সময় (যেমন—Cancer [ti])।[22]

মাই এনসিবিআই (My NCBI)

পাবমেডের ঐচ্ছিক সুবিধা "My NCBI" (বিনামূল্যে নিবন্ধনের মাধ্যমে) নিম্নলিখিত সরঞ্জামগুলো প্রদান করে:

  • অনুসন্ধান সংরক্ষণ করা
  • অনুসন্ধানের ফলাফল ফিল্টার করা
  • ই-মেইলের মাধ্যমে স্বয়ংক্রিয় আপডেট সেট করা
  • পাবমেড অনুসন্ধানের অংশ হিসেবে প্রাপ্ত রেফারেন্সের সেট সংরক্ষণ করা
  • ডিসপ্লে ফরম্যাট কনফিগার করা বা অনুসন্ধানের শব্দ হাইলাইট করা

এবং আরও অনেক অপশন।[28] "My NCBI" এলাকাটি ওয়েব-অ্যাক্সেসযুক্ত যেকোনো কম্পিউটার থেকে অ্যাক্সেস করা যায়। "My NCBI"-এর একটি পূর্ববর্তী সংস্করণের নাম ছিল "পাবমেড কাব্বি" (PubMed Cubby)।[29]

লিঙ্কআউট (LinkOut)

লিঙ্কআউট হলো NLM-এর একটি সুবিধা, যা সম্পূর্ণ পাঠ্যের স্থানীয় জার্নাল হোল্ডিংগুলোকে লিঙ্ক করে এবং উপলব্ধ করে।[30] প্রায় ৩,২০০টি সাইট (মূলত একাডেমিক প্রতিষ্ঠান) এই NLM সুবিধায় অংশগ্রহণ করে (২০১০ সালের মার্চ পর্যন্ত), ডেনমার্কের Aalborg University থেকে সিয়াটলের ZymoGenetics পর্যন্ত।[31] এই প্রতিষ্ঠানগুলোর ব্যবহারকারীরা পাবমেড অনুসন্ধানের ফলাফলের মধ্যে তাদের প্রতিষ্ঠানের লোগো দেখতে পান (যদি জার্নালটি সেই প্রতিষ্ঠানে থাকে) এবং সম্পূর্ণ পাঠ্য অ্যাক্সেস করতে পারেন। ২০১৯ সালের গ্রীষ্মে প্ল্যাটফর্মের বড় আপডেটের অংশ হিসেবে লিঙ্কআউটকে আউটসাইড টুলের সাথে একত্রিত করা হচ্ছে।[32]

পাবমেড কমন্স (PubMed Commons)

২০১৬ সালে, পাবমেড নিবন্ধের লেখকদের পাবমেড দ্বারা সূচিবদ্ধ নিবন্ধগুলোতে মন্তব্য করার অনুমতি দেয়। এই বৈশিষ্ট্যটি প্রাথমিকভাবে একটি পাইলট মোডে পরীক্ষা করা হয়েছিল (২০১৩ সাল থেকে) এবং ২০১৬ সালে এটিকে স্থায়ী করা হয়।[33] ২০১৮ সালের ফেব্রুয়ারিতে, পাবমেড কমন্স বন্ধ করে দেওয়া হয় কারণ "এর ব্যবহার ন্যূনতম ছিল"।[34][35]

আস্কমেডলাইন (askMEDLINE)

আস্কমেডলাইন একটি ফ্রি-টেক্সট ল্যাঙ্গুয়েজ কোয়েরি টুল হিসেবে তৈরি করা হয়েছিল, যা ব্যবহারকারীদের তাদের অনুসন্ধানে স্বাভাবিক ভাষা ব্যবহারের সুযোগ দিত। একজন বিশেষজ্ঞ অনুসন্ধানকারী যে বিশেষ শব্দভাণ্ডার ব্যবহার করতে পারেন তার বিপরীতে, এই টুলটি ব্যবহারকারীদের শুধুমাত্র স্বাভাবিক ভাষা ব্যবহার করে একটি দক্ষ MEDLINE/পাবমেড অনুসন্ধান করার সুযোগ দিত। এটি হ্যান্ডহেল্ডের জন্যও উপযুক্ত ছিল এবং গবেষক, চিকিৎসক বা সাধারণ জনগণের জন্য উদ্দিষ্ট ছিল যারা আনুষ্ঠানিক কোয়েরি ফরম্যাটিং সম্পর্কে পরিচিত নাও হতে পারেন।[36]

পাবমেড আইডেন্টিফায়ার

একটি PMID (পাবমেড আইডেন্টিফায়ার বা পাবমেড অনন্য শনাক্তকারী)[37] হলো একটি অনন্য পূর্ণসংখ্যা মান, যা ১ থেকে শুরু হয় এবং প্রতিটি পাবমেড রেকর্ডে বরাদ্দ করা হয়। একটি PMID এবং PMCID (পাবমেড সেন্ট্রাল আইডেন্টিফায়ার) এক নয়, যা বিনামূল্যে অ্যাক্সেসযোগ্য PubMed Central-এ প্রকাশিত সমস্ত কাজের জন্য শনাক্তকারী।[38]

একটি প্রকাশনায় PMID বা PMCID বরাদ্দ থাকা মানেই বিষয়বস্তুর ধরন বা গুণমান সম্পর্কে পাঠককে কিছু জানানো নয়।[39] PMIDগুলো সম্পাদককে চিঠি, সম্পাদকীয় মতামত, অপ-এড কলাম এবং সম্পাদক জার্নালে অন্তর্ভুক্ত করার জন্য বেছে নেওয়া যেকোনো অন্যান্য লেখার পাশাপাশি পিয়ার-রিভিউড গবেষণাপত্রে বরাদ্দ করা হয়।[40] শনাক্তকরণ নম্বরের অস্তিত্ব মানেই এই নয় যে গবেষণাপত্রগুলো জালিয়াতি, অযোগ্যতা বা অসদাচরণের জন্য প্রত্যাহার (retracted) করা হয়নি।[41] মূল গবেষণাপত্রের যেকোনো সংশোধনী সম্পর্কে ঘোষণার জন্য একটি PMID বরাদ্দ করা হতে পারে।

পাবমেড অনুসন্ধান উইন্ডোতে প্রবেশ করা প্রতিটি নম্বরকে ডিফল্টভাবে PMID হিসেবে বিবেচনা করা হয়। অতএব, পাবমেডের যেকোনো রেফারেন্স PMID ব্যবহার করে খুঁজে বের করা যেতে পারে।[42]

বিকল্প ইন্টারফেস

MEDLINE হলো এমন একটি ডেটাবেস যা পাবমেড (PubMed)-এর মাধ্যমে ব্যবহার করা যায়। বেশ কিছু কোম্পানি তাদের নিজস্ব প্ল্যাটফর্মের মাধ্যমে MEDLINE-এ প্রবেশের সুবিধা দিয়ে থাকে।

ন্যাশনাল লাইব্রেরি অফ মেডিসিন (NLM) তাদের MEDLINE-এর তথ্য বিভিন্ন বেসরকারি বিক্রেতাদের কাছে লিজ বা ইজারা দেয়। এর মধ্যে রয়েছে Embase, Ovid, Dialog, EBSCO, নলেজ ফাইন্ডার এবং আরও অনেক বাণিজ্যিক, অ-বাণিজ্যিক ও প্রাতিষ্ঠানিক সেবাদাতা প্রতিষ্ঠান।[43] ২০০৮ সালের অক্টোবর পর্যন্ত ৫০০টিরও বেশি লাইসেন্স ইস্যু করা হয়েছিল, যার মধ্যে ২০০টিরও বেশি ছিল যুক্তরাষ্ট্রের বাইরের সেবাদাতাদের জন্য। যেহেতু MEDLINE-এর ডেটা ব্যবহারের লাইসেন্স বিনামূল্যে পাওয়া যায়, তাই NLM কার্যত পাবমেডের জন্য বিভিন্ন ধরনের বিকল্প ইন্টারফেস এবং তৃতীয় পক্ষের সংযোজন তৈরির একটি উন্মুক্ত পরীক্ষাগার হিসেবে কাজ করে।[44] পেশাদারভাবে পরিচালিত খুব কম ডেটাবেসের মধ্যেই পাবমেড এই সুযোগটি প্রদান করে।

লু (Lu) বর্তমানে প্রচলিত এবং বিনামূল্যে ব্যবহারযোগ্য ২৮টি ওয়েব-ভিত্তিক পাবমেড সংস্করণের একটি তালিকা দিয়েছেন, যেগুলোর জন্য কোনো ইনস্টলেশন বা নিবন্ধনের প্রয়োজন হয় না। এগুলোকে চারটি শ্রেণিতে ভাগ করা হয়েছে:[44]

  1. অনুসন্ধানের ফলাফল র‍্যাঙ্কিং বা পর্যায়ক্রম নির্ধারণ, যেমন: eTBLAST; MedlineRanker;[45] MiSearch;[46]
  2. বিষয়, লেখক, জার্নাল ইত্যাদি অনুযায়ী ফলাফল ক্লাস্টার বা গুচ্ছবদ্ধ করা, যেমন: Anne O'Tate;[47] ClusterMed;[48]
  3. শব্দার্থবিদ্যা (semantics) এবং ভিজ্যুয়ালাইজেশন উন্নত করা, যেমন: EBIMed;[49] MedEvi.[50]
  4. উন্নত অনুসন্ধান ইন্টারফেস এবং তথ্য সংগ্রহের অভিজ্ঞতা, যেমন: askMEDLINE[51][52] BabelMeSH;[53] এবং PubCrawler.[54]

যেহেতু এই বিকল্পগুলোর বেশিরভাগই মূলত NLM/PubMed থেকে লাইসেন্সকৃত ডেটার ওপর নির্ভরশীল, তাই এদের "পাবমেড ডেরিভেটিভস" (PubMed derivatives) বা পাবমেড থেকে উদ্ভূত সংস্করণ হিসেবে অভিহিত করার পরামর্শ দেওয়া হয়েছে।[44] প্রায় ৯০ জিবি মূল পাবমেড ডেটাসেট সংরক্ষণ করার প্রয়োজন ছাড়াই, যে কেউ এরিক সেয়ার্স, পিএইচডি-এর লেখা "দ্য ই-ইউটিলিটিস ইন-ডেপথ: প্যারামিটারস, সিনট্যাক্স অ্যান্ড মোর" (The E-utilities In-Depth: Parameters, Syntax and More) বইটিতে বর্ণিত eutils-অ্যাপ্লিকেশন প্রোগ্রাম ইন্টারফেস ব্যবহার করে পাবমেড অ্যাপ্লিকেশন তৈরি করতে পারেন।[55] পিএমআইডি (PMID) নম্বর ইনপুট হিসেবে ব্যবহার করে বিভিন্ন সাইটেশন ফরম্যাট জেনারেটর হলো এমন ওয়েব অ্যাপ্লিকেশনের উদাহরণ যা এই ইন্টারফেস ব্যবহার করে। নমুনা ওয়েব পেজগুলোর মধ্যে রয়েছে Citation Generator – Mick Schroeder, Pubmed Citation Generator – Ultrasound of the Week, এবং Cite this for me।

২০২৫ সালে, জার্মান ন্যাশনাল লাইব্রেরি অফ মেডিসিন বা ZBMed পাবমেডের একটি আন্তর্জাতিকভাবে সমর্থিত ওপেন সোর্স সংস্করণ তৈরির পরিকল্পনা ঘোষণা করে।[56][57]

পাবমেডের ডেটা মাইনিং

পাবমেডের ডেটা মাইনিং বা তথ্য বিশ্লেষণের বিকল্প পদ্ধতিগুলোতে ম্যাটল্যাব (Matlab), পাইথন (Python) বা আর (R)-এর মতো প্রোগ্রামিং এনভায়রনমেন্ট ব্যবহার করা হয়। এক্ষেত্রে পাবমেডের কোয়েরিগুলো কোড হিসেবে লেখা হয় এবং পাবমেডে পাঠানো হয়, এরপর প্রাপ্ত ফলাফল সরাসরি প্রোগ্রামিং এনভায়রনমেন্টে প্রক্রিয়াজাত করা হয়।[58][59] রোগ, বছর, অঙ্গপ্রত্যঙ্গ ইত্যাদির মতো বিভিন্ন কি-ওয়ার্ড ব্যবহার করে পদ্ধতিগতভাবে কোয়েরি করার জন্য কোডগুলোকে স্বয়ংক্রিয় করা যায়।

বাল্ক বা বিপুল পরিমাণ তথ্য প্রক্রিয়াজাতকরণের জন্য সম্পূর্ণ পাবমেড ডেটাবেস এক্সএমএল (XML) ফরম্যাটে পাওয়া যায়, যা এফটিপি (FTP) সার্ভার থেকে ডাউনলোড করা যায়। বার্ষিক বেসলাইন ডেটা ডিসেম্বরে প্রকাশিত হয়, যার পরে প্রতিদিনের আপডেটেড ফাইলগুলো যুক্ত করা হয়।[60]

বায়োমেডিক্যাল ডেটাবেস হিসেবে প্রথাগত ভূমিকার পাশাপাশি, পাবমেড এখন বায়োমেডিক্যাল language model বা ভাষা মডেল প্রশিক্ষণের জন্য একটি সাধারণ উৎসে পরিণত হয়েছে।[61]

পাবমেডের ডেটা MEDOC-এর মতো অনানুষ্ঠানিক টুল ব্যবহার করে স্থানীয়ভাবে মিরর বা প্রতিলিপি করা সম্ভব।[62]

পাবমেডের লক্ষ লক্ষ রেকর্ড open data বা উন্মুক্ত ডেটাসেটগুলোকে সমৃদ্ধ করে, যেমন Unpaywall। লাইব্রেরিগুলো বিগ ডিল সাবস্ক্রিপশন বাতিল করার ক্ষেত্রে সহায়তার জন্য Unpaywall Journals-এর মতো ডেটা বিশ্লেষণ টুল ব্যবহার করে। লাইব্রেরিগুলো পাবমেড সেন্ট্রাল (PubMed Central)-এর মতো open archive বা উন্মুক্ত আর্কাইভের মাধ্যমে তাৎক্ষণিক open access বা উন্মুক্ত প্রবেশাধিকার পাওয়া যায় এমন উপকরণের জন্য সাবস্ক্রিপশন এড়িয়ে চলতে পারে।[63]

আরও দেখুন

তথ্যসূত্র

  1. ↑ PubMed.
  2. ↑ 2.0 2.1 (2000). Internet access to the National Library of Medicine. Effective Clinical Practice. 3 (5) 256–60.
  3. ↑ (2006-10-05). PubMed Celebrates its 10th Anniversary. Technical Bulletin.
  4. ↑ (2002-06-07). PubMed: MEDLINE Retrieval on the World Wide Web. Fact Sheet.
  5. ↑ (January 2001). "PubMed Central: The GenBank of the published literature". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 98 (2) 381–2. doi:10.1073/pnas.98.2.381.
  6. ↑ (January 2011). "UKPMC: a full text article resource for the life sciences". Nucleic Acids Research. 39 (Database issue) D58-65. doi:10.1093/nar/gkq1063.
  7. ↑ (2011). NLM Catalogue: Journals referenced in the NCBI Databases. NCBI.
  8. ↑ PubMed. PubMed. The search query "1800:2100[dp]" retrieves all results whose date of publication is between 1800 and 2100 inclusive.
  9. ↑ Key MEDLINE® Indicators. nlm.nih.gov.
  10. ↑ (October 2017). "Towards PubMed 2.0". eLife. 6 e28801. doi:10.7554/eLife.28801.
  11. ↑ (July–August 2016). MEDLINE/PubMed Production Improvements Underway. NLM Technical Bulletin. (411) e1.
  12. ↑ (September 2018). "How predatory journals leak into PubMed". CMAJ. 190 (35) E1042–E1045. doi:10.1503/cmaj.180154.
  13. ↑ Mallapaty, Smriti. (2025-03-04). 'Omg, did PubMed go dark?' Blackout stokes fears about database's future. Nature. 639 (8054) 288–288. doi:10.1038/d41586-025-00674-3.
  14. ↑ (September 2000). "Pragmatic approach is effective in evidence based health care". BMJ. 321 (7260) 566–7. doi:10.1136/bmj.321.7260.566/a.
  15. ↑ (January 2014). "How to improve your PubMed/MEDLINE searches: 2. display settings, complex search queries and topic searching". Journal of Telemedicine and Telecare. 20 (1) 44–55. doi:10.1177/1357633X13517067.
  16. ↑ Trawick, Bart. (21 January 2020). A New and Improved PubMed®. NLM Musings From the Mezzanine.
  17. ↑ Price, Michael. (22 May 2020). They redesigned PubMed, a beloved website. It hasn't gone over well. Science.
  18. ↑ (2004). PubMed via handhelds (PICO). Technical Bulletin.
  19. ↑ (2011). PubMed Mobile Beta. Technical Bulletin.
  20. ↑ (July 1993). "Searching the literature. Be systematic in your searching". BMJ. 307 (6895) 66. doi:10.1136/bmj.307.6895.66-a.
  21. ↑ (Spring 1999). The art and science of searching MEDLINE to answer clinical questions. Finding the right number of articles. International Journal of Technology Assessment in Health Care. 15 (2) 281–96. doi:10.1017/S0266462399015214.
  22. ↑ 22.0 22.1 (2018). "Cómo elaborar una estrategia de búsqueda bibliográfica". Enfermería Intensiva. 29 (4) 182–186. doi:10.1016/j.enfi.2018.09.001.
  23. ↑ (2010). Clinical Queries Filter Terms explained. NCBI.
  24. ↑ (June 2013). "Evaluating adherence to the International Committee of Medical Journal Editors' policy of mandatory, timely clinical trial registration". Journal of the American Medical Informatics Association. 20 (e1) e169-74. doi:10.1136/amiajnl-2012-001501.
  25. ↑ Computation of Related Articles explained. NCBI.
  26. ↑ (February 2006). Searching the literature using medical subject headings versus text word with PubMed. The Laryngoscope. 116 (2) 336–40. doi:10.1097/01.mlg.0000195371.72887.a2.
  27. ↑ 27.0 27.1 (March 2014). "How to improve your PubMed/MEDLINE searches: 3. advanced searching, MeSH and My NCBI". Journal of Telemedicine and Telecare. 20 (2) 102–12. doi:10.1177/1357633X13519036.
  28. ↑ (13 December 2010). My NCBI explained. NCBI.
  29. ↑ (2000). PubMed Cubby. Technical Bulletin.
  30. ↑ (2010). LinkOut Overview. NCBI.
  31. ↑ (2011). LinkOut Participants 2011. NCBI.
  32. ↑ An Updated PubMed is on its Way.
  33. ↑ PubMed Commons Team. (17 December 2015). Commenting on PubMed: A Successful Pilot.
  34. ↑ (2018-02-01). PubMed Commons to be Discontinued. NCBI Insights.
  35. ↑ (2018-02-02). PubMed shuts down its comments feature, PubMed Commons. Retraction Watch.
  36. ↑ (2005). askMedline. NCBI.
  37. ↑ Search Field Descriptions and Tags. National Center for Biotechnology Information.
  38. ↑ Keener, Molly. PMID vs. PMCID: What's the difference?. University of Chicago.
  39. ↑ (January 2019). "Exploring PubMed as a reliable resource for scholarly communications services". Journal of the Medical Library Association. 107 (1) 16–29. doi:10.5195/jmla.2019.433.
  40. ↑ (2023). "Anonymous editorials in biomedical research journals: Few in number but potentially problematic". Learned Publishing. 36 (3) 468–472. doi:10.1002/leap.1549.
  41. ↑ (2020). "Retracted publications and their citation in dental literature: A systematic review". Clinical and Experimental Dental Research. 6 (3) 383–390. doi:10.1002/cre2.292.
  42. ↑ (2023). "PubMed Features to Save Your Time". Journal of Hospital Librarianship. 24 1–9. doi:10.1080/15323269.2023.2291284.
  43. ↑ (2011). Leasing journal citations from PubMed/Medline. NLM.
  44. ↑ 44.0 44.1 44.2 (2011). "PubMed and beyond: a survey of web tools for searching biomedical literature". Database. 2011. doi:10.1093/database/baq036.
  45. ↑ (July 2009). "MedlineRanker: flexible ranking of biomedical literature". Nucleic Acids Research. 37 (Web Server issue) W141-6. doi:10.1093/nar/gkp353.
  46. ↑ (April 2009). "MiSearch adaptive pubMed search tool". Bioinformatics. 25 (7) 974–6. doi:10.1093/bioinformatics/btn033.
  47. ↑ (February 2008). "Anne O'Tate: A tool to support user-driven summarization, drill-down and browsing of PubMed search results". Journal of Biomedical Discovery and Collaboration. 3 2. doi:10.1186/1747-5333-3-2.
  48. ↑ (2011). ClusterMed. Vivisimo Clustering Engine.
  49. ↑ (January 2007). "EBIMed--text crunching to gather facts for proteins from Medline". Bioinformatics. 23 (2) e237-44. doi:10.1093/bioinformatics/btl302.
  50. ↑ (June 2008). "MedEvi: retrieving textual evidence of relations between biomedical concepts from Medline". Bioinformatics. 24 (11) 1410–2. doi:10.1093/bioinformatics/btn117.
  51. ↑ (2006). "askMEDLINE: a report on a year-long experience". AMIA ... Annual Symposium Proceedings. AMIA Symposium. 2006 923.
  52. ↑ (2005). "MeSH Speller + askMEDLINE: auto-completes MeSH terms then searches MEDLINE/PubMed via free-text, natural language queries". AMIA ... Annual Symposium Proceedings. AMIA Symposium. 2005 957.
  53. ↑ (2007). PICO Linguist and BabelMeSH: development and partial evaluation of evidence-based multilanguage search tools for MEDLINE/PubMed. Studies in Health Technology and Informatics. 129 (Pt 1) 817–21.
  54. ↑ (July 2004). "PubCrawler: keeping up comfortably with PubMed and GenBank". Nucleic Acids Research. 32 (Web Server issue) W16-9. doi:10.1093/nar/gkh453.
  55. ↑ Eric Sayers, PhD. (24 October 2018). The E-utilities In-Depth: Parameters, Syntax and More. NCBI.
  56. ↑ (28 May 2025). Germany Plans Global Alternative to PubMed. MedPage Today.
  57. ↑ OLSPub: Life sciences research needs a solid infrastructure. ZB MED - Informationszentrum Lebenswissenschaften.
  58. ↑ (2009). "Biopython: freely available Python tools for computational molecular biology and bioinformatics". Bioinformatics. 25 (11) 1422–1423. doi:10.1093/bioinformatics/btp163.
  59. ↑ (2017). "rentrez: An R package for the NCBI eUtils API". The R Journal. 9 520. doi:10.32614/rj-2017-058.
  60. ↑ (2023-11-04). "Notes on the data quality of bibliographic records from the MEDLINE database". Database. 2023. doi:10.1093/database/baad070.
  61. ↑ (3 August 2023). "Large language models encode clinical knowledge". Nature. 620 (7972) 172–180. doi:10.1038/s41586-023-06291-2.
  62. ↑ MrMimic/MEDOC
  63. ↑ Denise Wolfe. (2020-04-07). SUNY Negotiates New, Modified Agreement with Elsevier – Libraries News Center University at Buffalo Libraries. library.buffalo.edu.

বহিঃসংযোগ

1=P698


উৎস: ইংরেজি উইকিপিডিয়ার “PubMed” নিবন্ধের অনুবাদ। মূল নিবন্ধ: https://en.wikipedia.org/wiki/PubMed এই অনুবাদটি স্বয়ংক্রিয়ভাবে প্রস্তুত করা হয়েছে।

Retrieved from "https://ltrc.sciwiki.in/index.php?title=পাবমেড&oldid=2615"