Deinococcota

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Deinococcus radiodurans.jpg

Deinococcota (पर्यायवाची, "Deinococcus-Thermus") बैक्टीरिया का एक संघ है जिसमें केवल एक वर्ग, Deinococci (प्राचीन यूनानी δεινός (deinós), जिसका अर्थ है "भयानक", और κόκκος (kókkos), जिसका अर्थ है "बेरी"[1]) शामिल है, जो पर्यावरणीय खतरों के प्रति अत्यधिक प्रतिरोधी हैं, जिन्हें चरमरागी (extremophiles) के रूप में भी जाना जाता है।

इन बैक्टीरिया में मोटी कोशिका भित्तियाँ होती हैं जो उन्हें ग्राम-पॉजिटिव अभिरंजन (stains) देती हैं, लेकिन इनमें एक दूसरी झिल्ली भी शामिल होती है और इसलिए संरचना में ये ग्राम-नेगेटिव बैक्टीरिया के अधिक करीब होते हैं।[2]

वर्गीकरण

Deinococcota संघ में एक एकल वर्ग (Deinococci) और दो गण शामिल हैं:

Deinococcales
इसमें दो कुल (Deinococcaceae और Trueperaceae) शामिल हैं, जिनमें तीन वंश, Deinococcus, Deinobacterium और Truepera हैं।[3] Truepera radiovictrix इस गण का सबसे प्रारंभिक विचलन वाला सदस्य है। इस गण के भीतर, Deinococcus वंश, Deinobacterium और Truepera प्रजातियों के सापेक्ष एक विशिष्ट मोनोफाइलेटिक समूह बनाता है।
इस वंश में कई ऐसी प्रजातियाँ शामिल हैं जो विकिरण के प्रति प्रतिरोधी हैं; वे परमाणु कचरे और अन्य विषाक्त पदार्थों को खाने, अंतरिक्ष के निर्वात में जीवित रहने और अत्यधिक गर्मी और ठंड में जीवित रहने की अपनी क्षमता के लिए प्रसिद्ध हो गई हैं।
Thermales
इसमें गर्मी के प्रति प्रतिरोधी कई वंश (Marinithermus, Meiothermus, Oceanithermus, Thermus, Vulcanithermus, Rhabdothermus) शामिल हैं जिन्हें एक ही कुल, Thermaceae में रखा गया है। फाइलोजेनेटिक विश्लेषण दर्शाते हैं कि Thermales के भीतर, Meiothermus और Thermus प्रजातियाँ, Marinithermus, Oceanithermus, Vulcanithermus और Rhabdothermus के सापेक्ष एक मोनोफाइलेटिक समूह बनाती हैं जो गण के भीतर आउटग्रुप के रूप में शाखाबद्ध होते हैं। यह बताता है कि Meiothermus और Thermus प्रजातियाँ गण के अन्य वंशों की तुलना में एक-दूसरे के अधिक निकटता से संबंधित हैं।
Thermus aquaticus पॉलीमरेज़ चेन रिएक्शन के विकास में महत्वपूर्ण था जहाँ डीएनए को उबालने के करीब तक गर्म करने के बार-बार चक्रों के कारण एक थर्मो-स्टेबल डीएनए पॉलीमरेज़ एंजाइम, Taq पॉलीमरेज़ का उपयोग करना फायदेमंद होता है।

हालाँकि ये दोनों समूह एक सामान्य पूर्वज से विकसित हुए हैं, लेकिन प्रतिरोध के दोनों तंत्र काफी हद तक स्वतंत्र प्रतीत होते हैं।[4]

आणविक हस्ताक्षर

संरक्षित हस्ताक्षर इंडेल (CSIs) और प्रोटीन (CSPs) के रूप में आणविक हस्ताक्षर पाए गए हैं जो विशेष रूप से Deinococcota संघ से संबंधित सभी सदस्यों द्वारा साझा किए जाते हैं।[5] ये CSIs और CSPs विशिष्ट विशेषताएँ हैं जो इस अद्वितीय संघ को अन्य सभी जीवाणु जीवों से अलग करती हैं, और इनका विशेष वितरण शरीर क्रिया विज्ञान में देखे गए अंतरों के समानांतर है। ऐसे CSIs और CSPs भी पाए गए हैं जो संघ के भीतर गण और कुल-स्तरीय वर्गीकरण रैंकिंग का समर्थन करते हैं। गण-स्तरीय अंतर का समर्थन करने के लिए पाए गए कुछ CSIs के बारे में माना जाता है कि वे संबंधित चरमरागी विशेषताओं में भूमिका निभाते हैं। Thermales प्रजातियों में DNA-directed RNA polymerase सबयूनिट बीटा और DNA topoisomerase I में पाए गए CSIs तापरागी (thermophilicity) में शामिल हो सकते हैं, जबकि Deinococcales प्रजातियों में Excinuclease ABC, DNA gyrase, और DNA repair प्रोटीन RadA में पाए गए CSIs रेडियोप्रतिरोध (radioresistance) से जुड़े हो सकते हैं।

इसके अतिरिक्त, इस समूह के भीतर कुछ वंशों में, जिनमें Deinococcus, Thermus, और Meiothermus शामिल हैं, ऐसे आणविक हस्ताक्षर भी हैं जो उन्हें व्यक्तिगत वंश के रूप में सीमांकित करते हैं, जिसमें उनकी संबंधित प्रजातियाँ शामिल हैं, जो उन्हें समूह के बाकी हिस्सों और अन्य सभी बैक्टीरिया से अलग करने का साधन प्रदान करते हैं।[4] दो CSPs जो विशेष रूप से Deinococcus वंश से संबंधित सभी सदस्यों के लिए पाए गए थे, अच्छी तरह से पहचाने गए हैं और माना जाता है कि वे उनके विशिष्ट रेडियोप्रतिरोधी फेनोटाइप में भूमिका निभाते हैं। इन CSPs में डीएनए क्षति मरम्मत प्रोटीन PprA और एकल-फंसे डीएनए-बाइंडिंग प्रोटीन DdrB शामिल हैं।

CSIs Truepera radiovictrix के लिए भी विशिष्ट पाए गए हैं।[4]

फाइलोजेनी

section আরও দেখুন: Bacterial taxonomy वर्तमान में स्वीकृत वर्गीकरण List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)[6] और National Center for Biotechnology Information (NCBI) पर आधारित है।

16S rRNA आधारित LTP_07_2026[7] 120 मार्कर प्रोटीन आधारित GTDB रिलीज 11-RS232

1=2=2=1=2=Deinococcus Brooks & Murray 1981

1=1=2=2=2=Deinococcus

अनुक्रमित जीनोम

2009 तक इस संघ में उपभेदों के 10 अनुक्रमित जीनोम थे।[8]

  • Deinococcus radiodurans R1
  • Thermus thermophilus HB27
  • Thermus thermophilus HB8
  • Deinococcus geothermalis DSM 11300
  • Deinococcus deserti VCD115
  • Meiothermus ruber DSM 1279
  • Meiothermus silvanus DSM 9946
  • Truepera radiovictrix DSM 17093
  • Oceanithermus profundus DSM 14977

दो Meiothermus प्रजातियों का अनुक्रमण Genomic Encyclopedia of Bacteria and Archaea (GEBA) परियोजना के तत्वावधान में किया गया था, जिसका उद्देश्य रोगजन्यता या कुख्याति के आधार पर नहीं, बल्कि फाइलोजेनेटिक नवीनता के आधार पर जीवों का अनुक्रमण करना है।[9]

08, अनुक्रमित जीनोम की संख्या 1,341 है, जिनमें से 138 को NCBI द्वारा "reference genome" के रूप में लेबल किया गया है और 921 metagenome-असेम्बल्ड जीनोम हैं।[10]

इन्हें भी देखें

संदर्भ

  1. ↑ Deinococcus
  2. ↑ (2011). "Origin of diderm (Gram-negative) bacteria: antibiotic selection pressure rather than endosymbiosis likely led to the evolution of bacterial cells with two membranes". Antonie van Leeuwenhoek. 100 (2) 171–182. doi:10.1007/s10482-011-9616-8.
  3. ↑ (2005). "Truepera radiovictrix gen. nov., sp. nov., a new radiation resistant species and the proposal of Trueperaceae fam. nov.". FEMS Microbiol Lett. 247 (2) 161–169. doi:10.1016/j.femsle.2005.05.002.
  4. ↑ 4.0 4.1 4.2 Cite error: Invalid <ref> tag; no text was provided for refs named pmid27506333
  5. ↑ Cite error: Invalid <ref> tag; no text was provided for refs named pmid18076002
  6. ↑ Deinococcota
  7. ↑ The LTPlus. The All-Species Living Tree Project.
  8. ↑ Microbial Genomes.
  9. ↑ (2009). "A phylogeny-driven genomic encyclopaedia of Bacteria and Archaea". Nature. 462 (7276) 1056–1060. doi:10.1038/nature08656.
  10. ↑ Genome (taxon 1297). NCBI.

स्रोत: अंग्रेज़ी विकिपीडिया के “Deinococcota” लेख का अनुवाद। मूल लेख: https://en.wikipedia.org/wiki/Deinococcota यह अनुवाद स्वचालित रूप से तैयार किया गया है।

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