एक्विफिकोटा
Aquificota
एक्विफिकोटा (Aquificota) फाइलम बैक्टीरिया का एक विविध समूह है जो कठोर पर्यावरणीय परिस्थितियों में रहते हैं।[1] एक्विफिकोटा नाम इस फाइलम को इस समूह के भीतर पहचाने गए एक शुरुआती जीनस, Aquifex ("जल निर्माता") के आधार पर दिया गया था, जो हाइड्रोजन के ऑक्सीकरण द्वारा पानी का उत्पादन करने में सक्षम है। इन्हें झरनों, तालाबों और महासागरों में पाया गया है। ये autotroph (स्वपोषी) हैं, और अपने वातावरण में प्राथमिक कार्बन फिक्सर हैं। ये बैक्टीरिया Gram-negative, बीजाणु-रहित (non-spore-forming) रॉड होते हैं। ये वास्तविक बैक्टीरिया (डोमेन Bacteria) हैं, न कि चरम वातावरण के अन्य निवासी, Archaea।
वर्गीकरण (Taxonomy)
एक्विफिकोटा में वर्तमान में 15 जीनस और 42 मान्य रूप से प्रकाशित प्रजातियां शामिल हैं।[2] इस फाइलम में तीन क्लास शामिल हैं, जिनमें से प्रत्येक का अपना ऑर्डर है। एक्विफिकेल्स (Aquificales) में Aquificaceae और Hydrogenothermaceae परिवार शामिल हैं, जबकि Desulfurobacteriaceae डेसल्फुरोबैक्टीरियल्स (Desulfurobacteriales) के भीतर एकमात्र परिवार है। Thermosulfidibacter takaii को दोनों ऑर्डरों से इसकी फाइलोजेनेटिक भिन्नता के आधार पर फाइलम के भीतर किसी परिवार में नहीं रखा गया है। इसे वर्तमान में एक्विफिकेल्स के सदस्य के रूप में वर्गीकृत किया गया है, लेकिन इसने डेसल्फोबैक्टीरियासी (Desulfobacteriaceae) के साथ अधिक शारीरिक समानता दिखाई है।
आणविक हस्ताक्षर और फाइलोजेनेटिक स्थिति
तुलनात्मक जीनोमिक अध्ययनों ने कई conserved signature indels (CSIs) की पहचान की है जो एक्विफिकोटा फाइलम से संबंधित सभी प्रजातियों के लिए विशिष्ट हैं और संभावित आणविक मार्कर प्रदान करते हैं।[3] एक्विफिकेल्स ऑर्डर को डेसल्फोबैक्टीरियल्स से विभिन्न प्रोटीनों में कई CSIs द्वारा अलग किया जा सकता है जो प्रत्येक समूह के लिए विशिष्ट हैं। परिवार स्तर पर अतिरिक्त CSIs पाए गए हैं, और इनका उपयोग एक्विफिकोटा और Hydrogenothermaceae को अन्य सभी बैक्टीरिया से अलग करने के लिए किया जा सकता है। देखे गए CSI वितरण के समानांतर, एक्विफिकोटा के भीतर के ऑर्डर भी शारीरिक रूप से एक-दूसरे से भिन्न हैं। डेसल्फुरोबैक्टीरियल्स के सदस्य सख्त एनारोब (अवायवीय) हैं जो ऊर्जा के लिए विशेष रूप से हाइड्रोजन का ऑक्सीकरण करते हैं, जबकि एक्विफिकेल्स से संबंधित सदस्य माइक्रोएरोफिलिक हैं, और हाइड्रोजन के अलावा अन्य यौगिकों (जैसे सल्फर या थायोसल्फेट) को ऑक्सीकृत करने में सक्षम हैं।
कई CSIs की भी पहचान की गई है जो एक्विफिकोटा की प्रजातियों के लिए विशिष्ट हैं और इस फाइलम के लिए संभावित आणविक मार्कर प्रदान करते हैं।[1] इसके अतिरिक्त, SecA प्रीप्रोटीन ट्रांसलोकेस में 51-अमीनो-अम्ल का सम्मिलन (insertion) पहचाना गया है जो एक्विफिकोटा के सभी सदस्यों के साथ-साथ Thermotogales ऑर्डर के सभी सदस्यों द्वारा साझा किया जाता है। फाइलोजेनेटिक अध्ययनों ने प्रदर्शित किया कि बैक्टीरिया के इन दो असंबंधित समूहों के भीतर एक ही CSI की उपस्थिति lateral gene transfer के कारण नहीं है, बल्कि यह CSI संभवतः चयनात्मक दबाव के कारण थर्मोफाइल्स के इन दो समूहों में स्वतंत्र रूप से विकसित हुआ है। 51 अमीनो एसिड का सम्मिलन ADP/ATP बाइंडिंग साइट के पास SecA की सतह पर स्थित है। आणविक गतिशील सिमुलेशन ने पानी के अणुओं का एक नेटवर्क प्रकट किया जो 51 aa CSI और ADP अणुओं के अवशेषों के बीच एक मध्यवर्ती संपर्क बनाता है, जो ADP/ATP और प्रोटीन के बीच बने हाइड्रोजन बॉन्ड को स्थिर करने का कार्य करता है। यह सुझाव दिया गया है कि पानी के अणुओं, CSI अवशेषों और ADP/ATP के बीच बने हाइड्रोजन बॉन्ड का नेटवर्क उच्च तापमान पर SecA प्रोटीन के साथ ATP/ADP बाइंडिंग को बनाए रखने में मदद करता है, जो बैक्टीरिया की समग्र थर्मोस्टेबिलिटी में योगदान देता है।
16S rRNA जीन पेड़ों में, एक्विफिकोटा प्रजातियां Thermotogota फाइलम (हाइपरथर्मोफिलिक जीवों वाला एक अन्य फाइलम) के निकट आर्कियल-बैक्टीरियल शाखा बिंदु के पास शाखा बनाती हैं।[4] हालांकि, थर्मोटोगाटा के साथ एक्विफिकोटा का करीबी संबंध और एक्विफिकोटा की गहरी शाखा कुछ अन्य जीन/प्रोटीन अनुक्रमों और कई अत्यधिक संरक्षित सार्वभौमिक प्रोटीन 16S-23S-5S ओपेरॉन में CSIs पर आधारित फाइलोजेनेटिक अध्ययनों द्वारा समर्थित नहीं है। उनके rRNAs की बहुत उच्च G+C सामग्री (यानी 62% से अधिक) के विपरीत, जो उच्च विकास तापमान पर उनकी द्वितीयक संरचनाओं की स्थिरता के लिए आवश्यक है, यह अनुमान कि एक्विफिकोटा एक गहरी शाखा वाली वंशावली का गठन नहीं करते हैं, कई महत्वपूर्ण प्रोटीनों (जैसे Hsp70, Hsp60, RpoB, RpoB और AlaRS) में CSIs द्वारा स्वतंत्र रूप से मजबूती से समर्थित है, जो इसे प्रोटियोबैक्टीरिया (Proteobacteria) फाइलम, विशेष रूप से Campylobacterota के निकट रखने का समर्थन करते हैं। प्रोटियोबैक्टीरिया के साथ एक्विफिकोटा का एक विशिष्ट संबंध प्रोटीन inorganic pyrophosphatase में दो-अमीनो-अम्ल CSI द्वारा समर्थित है, जो विशिष्ट रूप से इन दो फाइलम की प्रजातियों में पाया जाता है। Cavalier-Smith ने भी सुझाव दिया है कि एक्विफिकोटा प्रोटियोबैक्टीरिया से निकटता से संबंधित हैं। कुछ इंडेल्स या एकल जीनों पर आधारित उपरोक्त उद्धृत विश्लेषणों के विपरीत, सूचनात्मक जीनों पर विश्लेषण, जो गैर-सूचनात्मक जीनों की तुलना में Aquifex वंशावली में कम बार स्थानांतरित होते दिखाई दिए, ने अक्सर एक्विफिकेल्स को थर्मोटोगाल्स के करीब रखा। ये लेखक कैंपिलोबैक्टीरियोटा (Campylobacterota) के साथ एक्विफिकोटा के अक्सर देखे जाने वाले समूहीकरण को साझा पारिस्थितिक निचे (ecological niches) के कारण बार-बार होने वाले horizontal gene transfer का परिणाम बताते हैं।
थर्मोटोगाटा के साथ, एक्विफिकोटा thermophilic यूबैक्टीरिया हैं।[5]
फाइलोजेनी (Phylogeny)
वर्तमान में स्वीकृत वर्गीकरण List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)[6] और National Center for Biotechnology Information (NCBI) पर आधारित है।
| 16S rRNA आधारित LTP_10_2024[7] | 120 मार्कर प्रोटीन आधारित GTDB 10-RS226 |
|---|---|
|
1=1=Thermosulfidibacteraceae 1=2=2=Aquificaceae [incl. "Hydrogenobaculaceae"] |
1=2=1=2=2=Aquificaceae Reysenbach 2002 |
इन्हें भी देखें
संदर्भ
- ↑ 1.0 1.1 (January 2006). "Molecular signatures in protein sequences that are characteristics of the phylum Aquificae". Int. J. Syst. Evol. Microbiol.. 56 (Pt 1) 99–107. doi:10.1099/ijs.0.63927-0.
- ↑ J.P. Euzéby. Aquificae. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN).
- ↑ Cite error: Invalid
<ref>tag; no text was provided for refs namedpmid23812969 - ↑ Huber, R. and Hannig, M. (2006) Thermotogales. Prokaryotes 7: 899-922.
- ↑ Cite error: Invalid
<ref>tag; no text was provided for refs namedpmid19000750 - ↑ Aquificota
- ↑ The LTP.
स्रोत: अंग्रेज़ी विकिपीडिया के “Aquificota” लेख का अनुवाद। मूल लेख: https://en.wikipedia.org/wiki/Aquificota यह अनुवाद स्वचालित रूप से तैयार किया गया है।
